It-tisqija hija waħda mill-kompiti ewlenin tal-ġestjoni tal-pjanti bonsai. It-tisqija tidher sempliċi, iżda mhux faċli li tisqiha kif suppost. It-tisqija għandha ssir skont l-ispeċi tal-pjanta, il-bidliet staġjonali, il-perjodu tat-tkabbir, il-perjodu tal-fjoritura, il-perjodu ta' rqad u l-kundizzjonijiet tat-temp tal-pjanta. Il-kontroll tal-ħin u l-ammont tat-tisqija huwa importanti ħafna għat-tkabbir tal-pjanti. Il-mewt ta' xi pjanti bonsai hija direttament relatata ma' tisqija mhux xierqa.

Minbarra li tipprovdi ilma u nutrijenti lill-pjanti mħawla fil-qsari, il-ħamrija tal-qsari żżomm ukoll in-nifs normali tal-pjanti. Meta l-ħamrija tal-qsari jkollha biżżejjed umdità, il-partiċelli tal-ħamrija jespandu, u joħorġu l-arja fil-lakuni bejn il-partiċelli, u jikkawżaw nuqqas ta' arja fil-ħamrija tal-qsari; meta l-ħamrija tal-qsari tkun niexfa jew relattivament niexfa, il-partiċelli tal-ħamrija jiċkienu, il-volum isir iżgħar, u l-lakuni bejn il-partiċelli jerġgħu jidhru. Il-lakuni jimtlew bl-arja.

Hekk kif il-ħamrija tinbidel bejn niexfa u mxarrba, l-arja fil-ħamrija tal-borma tiċċirkola wkoll kontinwament, u tippermetti lill-għeruq tal-pjanti jieħdu n-nifs b'mod normali. Wara kull tisqija, l-għeruq tal-pjanta jkunu jistgħu jittolleraw in-nuqqas ta' ossiġnu fil-ħamrija tal-borma f'perjodu qasir ta' żmien. Madankollu, jekk il-ħamrija tal-borma tkun imxarrba wisq għal żmien twil, li tirriżulta f'nuqqas ta' ossiġnu fit-tul, dan jikkawża erożjoni tal-għeruq u mard ieħor; Jekk il-ħamrija tkun niexfa għal żmien twil, għalkemm ikun hemm biżżejjed ossiġnu fil-ħamrija tal-borma, il-pjanti ma jistgħux jassorbu l-ilma għal żmien twil, li huwa wkoll ta' detriment għat-tkabbir tal-pjanti u jista' saħansitra jikkawża li jmutu. Għalhekk, meta tisqija l-pjanti tal-bonsai, għandu jiġi segwit il-prinċipju ta' "tisqijahomx meta jkunu niexfa, saqqihom sew".

Tisqija u deidrazzjoni insuffiċjenti tal-pjanti jikkawżaw li l-friegħi jidbiel u jinżlu, u l-weraq jinxef, isir isfar, u jaqa'. Fil-każ ta' speċi koniferi, il-labar jirtabu u jitilfu s-sensazzjoni qawwija u tax-xewk tagħhom. Meta n-nuqqas ta' ilma jkun sever, il-qoxra tal-friegħi tiċkien bħal ġilda tat-tiġieġ. Jekk tiltaqa' ma' din is-sitwazzjoni fis-sajf, għandek iċċaqlaq il-pjanta immedjatament f'post fid-dell. Wara li t-temperatura tinżel, roxx l-ilma fuq il-weraq l-ewwel, imbagħad ferra ftit ilma fil-borma, u mbagħad ferra l-ilma sewwa wara siegħa.

Għal pjanti deidratati ħafna, kun żgur li ma tisqix biżżejjed f'daqqa, għax meta l-pjanta tkun deidratata ħafna, il-kortiċi tal-għerq tkun naqset u tkun qrib ix-xilema. Jekk ammont kbir ta' ilma jiġi pprovdut f'daqqa, is-sistema tal-għeruq tespandi minħabba l-assorbiment rapidu tal-ilma, u tikkawża li l-kortiċi tinqasam, u twassal għall-mewt tal-pjanta, għalhekk jeħtieġ li jkun hemm proċess ta' adattament gradwali. Wara li l-pjanti li huma serjament neqsin mill-ilma jgħaddu mit-trattament ta' hawn fuq, l-aħjar li jinżammu taħt barrakka tad-dell għal ftit jiem, u mbagħad ikkultivawhom fix-xemx wara li jkunu b'saħħithom. Madankollu, tisqix iżżejjed. Minbarra li jikkawża li l-pjanti jikbru b'mod wieqaf, u jaffettwa l-forma tas-siġra u l-valur ornamentali, tisqija eċċessiva tista' wkoll faċilment tikkawża taħsir u mewt tal-għeruq. Qsari tal-bonsai żgħar jeħtieġu inqas ħamrija, għalhekk huwa speċjalment importanti li tisqijahom fil-ħin it-tajjeb u fl-ammont it-tajjeb.